banner

Новости

Feb 24, 2024

Ферментативная стабилизация и функция термотолерантности внутренне неупорядоченных белков LEA2 финиковой пальмы

Том 13 научных отчетов, номер статьи: 11878 (2023) Цитировать эту статью

316 Доступов

1 Альтметрика

Подробности о метриках

У финиковой пальмы гены LEA2 изобилуют шестьюдесятью двумя членами, которые почти все распространены повсеместно. Однако их функции и взаимодействие с потенциальными молекулами-мишенями в значительной степени не изучены. В этом исследовании пять генов LEA2 финиковой пальмы, PdLEA2.2, PdLEA2.3, PdLEA2.4, PdLEA2.6 и PdLEA2.7, были клонированы, секвенированы, и три из них: PdLEA2.2, PdLEA2.3 и PdLEA2. .4 были функционально охарактеризованы по их влиянию на термостабильность двух различных ферментов: лактатдегидрогеназы (ЛДГ) и β-глюкозидазы (bglG) in vitro. В целом PdLEA2.3 и PdLEA2.4 были умеренно гидрофильными, PdLEA2.7 — слегка гидрофобными, а PdLEA2.2 и PdLEA2.6 — ни тем, ни другим. Прогнозирование последовательности и структуры показало наличие участка гидрофобных остатков вблизи N-конца, который потенциально мог бы образовывать трансмембранную спираль в PdLEA2.2, PdLEA2.4, PdLEA2.6 и PdLEA2.7. Помимо трансмембранной спирали, предсказание вторичных и третичных структур показало наличие неупорядоченной области, за которой следует уложенная область β-листа во всех белках PdLEA2. Кроме того, три очищенных рекомбинантных белка PdLEA2 были получены in vitro, и их присутствие в ферментативной реакции ЛДГ повышало активность и уменьшало образование агрегатов ЛДГ при тепловом стрессе. В ферментативных анализах bglG белки PdLEA2 дополнительно продемонстрировали свою способность сохранять и стабилизировать ферментативную активность bglG.

Растения развили сложные регуляторные механизмы, позволяющие противостоять воздействию неблагоприятных климатических условий. Механизмы повышения толерантности к абиотическому стрессу во многом зависят от белковых молекул, которые непосредственно функционируют и регулируют различные физиологические процессы и сигнальные пути растений. Семейство генов белков позднего эмбриогенеза (LEA) представляет собой группу функциональных белков, которые защищают и уменьшают повреждения растительных клеток в условиях абиотического стресса1. Эти белки имеют неупорядоченную структуру и характеризуются повторяющимися мотивами2. На основании мотивов консервативной аминокислотной последовательности белки LEA были разделены на восемь отдельных групп, причем белки LEA2 являются наиболее преобладающей группой в растениях. Первоначально белки LEA2 были обнаружены в больших количествах в зрелых семенах Gossypium hirsutum3 и повсеместно экспрессировались в цветущих и нецветковых растениях4. В основном они накапливаются на поздних стадиях развития семян и в вегетативных тканях в результате реакции растений на ограничения окружающей среды5. Белки LEA2 чрезвычайно гидрофильны и характеризуются как внутренне неупорядоченные белки (IDP), которые могут изменять свою конформацию в ответ на изменения окружающей микросреды6. Среди подсемейства белков LEA2 дегидрины (DHN) представляют собой хорошо известную биохимическую группу, которая в основном состоит из высокой доли заряженных и полярных аминокислот и низкой доли гидрофобных и неполярных остатков7.

Белки LEA2 широко участвуют в физиологических реакциях растений, повышая устойчивость к абиотическому стрессу. Сверхэкспрессия Triticum aestivum L., TaLEA2-1 в пшенице усиливала рост корней, высоту растений и приводила к более высокой активности каталазы по сравнению с проростками дикого типа. TaLEA2-1 обеспечивал улучшенную толерантность к засолению у трансгенных растений пшеницы TaLEA2-15. Кроме того, в недавнем исследовании было обнаружено, что ген LEA2, PtrDHN-3, из Populus trichocarpa, играет важную роль в устойчивости к солевому стрессу и засухе8. Было замечено, что сверхэкспрессия PtrDHN-3 повышала солеустойчивость трансгенных дрожжей, а также улучшала скорость прорастания, сырую массу и содержание хлорофилла в трансгенных растениях Arabidopsis thaliana в условиях солевого стресса8. Кроме того, растения Arabidopsis, трансформированные генами LEA2 хлопка, показали более высокий рост в условиях засухи по сравнению с диким типом9. Более того, у кукурузы был выделен ген DHN KS-типа, ZmDHN13, и его сверхэкспрессия в трансгенных растениях табака повышала толерантность к окислительному стрессу10. В другом исследовании сверхэкспрессия гена LEA2 Prunus mume в трансформированном табаке и кишечной палочке улучшила устойчивость к холодовому стрессу11. Кроме того, сверхэкспрессия двух DRE A. thaliana, AtDREB1A или AtDREB2A, приводила к индукции связанных с холодовым стрессом генов белков LEA2, таких как rd29A и COR4712. В предполагаемых промоторах генов LEA2 высокогорного хлопчатника G. hirsutum было обнаружено несколько цис-элементов, связанных с абиотическим стрессом. Он включал MYBCORE, ABRELATERD1, ABRE-подобную последовательность и элементы ACGTATERD1, которые, как известно, играют функциональную роль в абиотических стрессах13,14. Присутствие этих элементов, способствующих стрессу, убедительно подтверждает роль белков LEA2 в повышении толерантности к абиотическому стрессу у растений, растущих в агрессивных климатических условиях.

 7) (Table 1), indicating that the PdLEA2 proteins were mostly basic. The calculated GRAVY index (Table 1), an indication of the average hydrophobicity of the protein, showed that PdLEA2.7 was slightly hydrophobic (> 0), PdLEA2.3 and PdLEA2.4 were moderately hydrophilic (< 0), and PdLEA2.2 and PdLEA2.6 had a score close to 0. However, expanding this to the residue level, the Kyte-Doolittle plots (Fig. 1A) indicated the existence of stretches of highly hydrophobicity regions near the N-terminus of PdLEA2.2, PdLEA2.4, PdLEA2.6 and PdLEA2.7. The PdLEA2.2, PdLEA2.4, PdLEA2.6, and PdLEA2.7 were classified as unstable proteins with instability index of 49.27, 43.09, 41.89, and 41.83, respectively. Whereas PdLEA2.3 was quite stable with an instability index of 21.6. The aliphatic index of the five PdLEA2 proteins was high and ranged between 84.4 to 105.5, which indicated that PdLEA2 proteins are thermostable over a broad range of temperatures./p> 90; cyan: 70 < pLDDT < 90; yellow: 50 < pLDDT < 90; orange: pLDDT < 50. The N- and C-termini of the proteins and the transmembrane (TM) region predicted by MEMSTAT are marked./p>

ДЕЛИТЬСЯ